科普时间 | 肉瘤患者怎么检测NTRK?
对肉瘤患者来说,真正和靶向治疗关系最密切的,通常是NTRK基因融合。而且“怎么测”,并不是只有一种办法。不同肉瘤类型、不同医院、不同样本条件,检测路径可能不一样[1-4]。
先把最关键的一句记住:
不是所有“NTRK异常”都一样
但对NTRK来说,最重要、最有成熟用药价值的,是基因融合(fusion)。可以把它想成:
所以对肉瘤患者来说,更准确的是:我这类肉瘤,要不要查NTRK基因融合?
更该想到做NTRK检测?
就比较像NTRK融合
相关肿瘤的患者。
最典型的是婴儿型纤维肉瘤(infantilefibrosarcoma,IFS),它和ETV6-NTRK3融合关系非常密切。除此之外,一些儿童/年轻人的梭形细胞肉瘤等,也可能出现NTRK融合[2,5,6]。
不能顺利切除,
或者已经转移的肉瘤患者。
因为这时候如果真找到一个可打的融合靶点,才更有机会改变治疗路径,比如争取靶向治疗、临床试验,或者为后续手术创造条件[2,4]。
病理又比较少见、年轻发病的患者。
这类患者不是说一定有NTRK融合,而是更值得做更完整的融合检测,别把真正能打的靶点漏过去[2,4]。
所以很多时候,患者不一定要重新挨一针,先要做的反而是问一句:
我原来的病理组织够不够做分子检测?
IHC,也就是免疫组化。查NTRK时常说的是pan-TRKIHC。它的优点是快、便宜、很多病理科都能做,所以很适合拿来做初筛[3,4]。
你可以把它想成机场安检的“初筛门”——先看看有没有可疑信号。但问题是,IHC不是最终判案工具。
因为pan-TRK阳性,不等于一定存在NTRK融合;而且在某些肿瘤里会有假阳性,在NTRK3融合里还可能出现假阴性[3,4]。所以,IHC更像“先筛一下”,不是“阳性就直接吃药”。
某一条线看有没有断开”
FISH是荧光原位杂交。它的优点是技术成熟、很多实验室会做,对石蜡组织也比较友好。但它的问题是:通常一次只能盯一个基因或一种模式看,而且不太擅长把融合伴侣一次性讲清楚[4]。
所以如果医生已经高度怀疑某个特定融合,比如IFS里去盯ETV6-NTRK3,FISH就可能很好用。但如果你面对的是“我不知道它到底和谁融合了”,FISH就不够全面了[2,4-6]。
适合“已知答案型”问题
RT-PCR的逻辑和FISH有点像。如果你非常明确怀疑某个固定融合,它可以很快、很灵敏。但NTRK的融合伴侣很多,现实里并不是每个肉瘤都提前知道“它最可能和谁接错线”,所以RT-PCR不太适合做宽范围的初筛[2,4]。
如果把前面几种方法比作“用手电筒一处处照”,那NGS(二代测序)更像是一次把更大范围都扫一遍。它不仅能查NTRK,还可能同时看到其他基因改变,对少见肉瘤尤其有价值[3,4]。
但NGS也分两种重要思路:
- DNA-NGS:是从DNA层面找重排线索。优点是很多面板已经成熟;缺点是对某些融合,尤其涉及NTRK2/NTRK3时,可能因为基因太大、结构太复杂而漏检[4]。
- RNA-NGS:是从RNA层面直接看“最后到底拼成了什么转录本”。它更贴近“有没有真正形成融合产物”,所以在很多综述和最佳实践文章里,RNA-basedNGS被认为是检测NTRK融合的优选方法[3,4]。
- DNA-NGS像是在看电路图有没有被改过;
- RNA-NGS更像是在看这台机器最后到底有没有真的启动那个错误程序。
高概率NTRK融合肿瘤
比如婴儿型纤维肉瘤。这时候可以考虑直接做特异性检测,比如针对已知融合的FISH/RT-PCR,或者更直接地做RNA-NGS[2,4-6]。
NTRK融合本身概率不高,
但又想别漏
这时候更常见的是两种路子:
1. 有条件就直接做RNA-NGS/含融合分析的NGS面板
2. 如果资源有限,先做pan-TRKIHC筛查,阳性后再用分子方法确认[3,4]。
但医生仍然很怀疑
别急着把门彻底关死。因为DNA-NGS不是对所有NTRK融合都一样敏感。如果临床和病理都很像,补做RNA-NGS很有意义[4]。
[4] Hechtman JF. NTRK insights: best practices for pathologists. Mod Pathol. 2022;35(3):298-305. doi:10.1038/s41379-021-00913-8. PMID: 34531526.
[5] Miettinen M, Felisiak-Golabek A, Luiña Contreras A, et al. New fusion sarcomas: histopathology and clinical significance of selected entities. Hum Pathol. 2019;86:57-65. doi:10.1016/j.humpath.2018.12.006. PMID: 30633925.
[6] Hung YP, Fletcher CDM, Hornick JL. Evaluation of pan-TRK immunohistochemistry in infantile fibrosarcoma, lipofibromatosis-like neural tumour and histological mimics. Histopathology. 2018;73(4):634-644. doi:10.1111/his.13666. PMID: 29863809.
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